Pimpinan universitas adalah Rektor dan para Wakil Rektor, berperan sebagai penanggung jawab utama terselenggaranya kegiatan universitas, dengan mengemban amanah tugas antara lain menjalankan fungsi pengelolaan universitas secara keseluruhan, melaksanakan penyelenggaraan pendidikan, penelitian dan pengabdian kepada masyarakat, membina sivitas akademika (dosen & mahasiswa) serta membina hubungan dengan alumni, baik di lingkungan universitas dan masyarakat. Rektor dan Wakil Rektor diangkat dan diberhentikan oleh Pimpinan Pusat Muhammdiyah atas usul Majelis Diktilitbang berdasarkan alur ketentuan yang telah diatur. Berikut ini adalah susunan Pimpinan UMS periode 2017-2021,
 |
Prof. Dr. Sofyan Anif, M.Si |
|---|---|
| Rektor | |
| Meraih gelar doktor manajemen pendidikan pada tahun 2014 di Universitas Negeri Semarang. Pernah menjabat sebagai Wakil Rektor IV pada periode jabatan 2013-2017 | |
| Alamat: Gedung Induk Siti Walidah Lt.6 UMS | |
| Telp: +62-271-717417 ext 1000 |
 |
Dr. Muhammad Da'i, M.Si., Apt |
|---|---|
| Wakil Rektor I Bidang Akademik dan Kerjasama | |
| Meraih gelar doktor pada tahun 2008 di Universitas Gadjah Mada. Memperoleh predikat "Dosen Berprestasi" kopertis VI tahun 2008 | |
| Alamat: Gedung Induk Siti Walidah Lt.6 UMS | |
| Telp: +62-271-717417 ext 1101 |
 |
Ir. Sarjito, M.T., Ph.D |
|---|---|
| Wakil Rektor II Keuangan dan Sistem Informasi | |
| Meraih gelar doktor dari Kingston University (UK) pada tahun 2012. Menjabat kembali sebagai Wakil Rektor II pada periode 2017-2021 | |
| Alamat: Gedung Induk Siti Walidah Lt.6 UMS | |
| Telp: +62-271-717417 ext 1328 |
 |
Taufik, S.Psi., M.Si., Ph.D |
|---|---|
| Wakil Rektor III Bidang Kemahasiswaan, Alumni, dan Pengkaderan | |
| Meraih gelar doktor pada tahun 2011 di Tilburg University Belanda. Mendapat penghargaan "Peneliti Muda" oleh LIPI pada tahun 2007 | |
| Alamat: Gedung Induk Siti Walidah Lt.6 UMS | |
| Telp: +62-271-717417 ext 1103 |
 |
Dr. Muhammad Musiyam, M.T., |
|---|---|
| Wakil Rektor IV Bidang Al Islam dan Kemuhammadiyahan, Sumber Daya Manusia (SDM), dan Aset | |
| Pernah menjabat sebagai Wakil Rektor I periode 2009-2013. Menguasai bidang keahlian Geografi Regional, Geografi Ekonomi, Perencanaan dan Pengembangan Wilayah | |
| Alamat: Gedung Induk Siti Walidah Lt.6 UMS | |
| Telp: +62-271-717417 ext 1--- |
